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Formations / 8-12 Janvier 2007 ENS Paris
9-12 Janvier 2007, Master (M2) de génetique Paris VII :
Travaux Pratiques sur les puces à ADN
Cours et supports multimédias
- Introduction - Frédéric DEVAUX - Présentation
au format PDF (5.2 Mb)
- Méthodes bioinformatique d'analyse des puces à ADN, partie
1, analyse d'image et normalisation - Stéphane LE CROM - Présentation
au format PDF (16 Mb)
Travaux pratiques : protocoles expérimentaux
- Document détaillant les différents protocoles mis en oeuvre
pendant la partie pratique - Document
au format PDF (97.4 Kb)
Tous les protocoles expérimentaux décrits et
utilisés pendant cette formation sont ceux de la plate-forme transcriptome.
Ces protocoles au format HTML et PDF sont disponibles
dans la section "protocoles" du site de la plate-forme. Des tutoriaux
vidéos sont égalements disponibles.
Travaux dirigés : analyse informatique des images
et normalisation des données
- Document détaillant les différentes étapes effectuées
lors de l'analyse de l'image - Document
au format PDF (4 Mb)
- Grille d'analyse indiquant l'identification de chaque spot - Fichier
au format .GAL (1.2 Mb)
- Quelques informations à connaître pour bien exploiter Excel
durant cette formation - Document
au format PDF (808.9 Kb)
- Document détaillant les différentes étapes effectuées
lors de la normalisation des résultats - Document
au format PDF (98.5 Kb)
- Lien vers le script R
qui sera utilisé pendant le TD
Travaux dirigés : recherche de gènes significatifs
dans des expériences répétées
- Document sur le prétraitement des données avant l'utilisation
de méthodes de regroupement - Document
au format PDF (925.4 Kb)
- Document détaillant les différentes étapes de la recherche
de gènes significatifs - Document
au format PDF (941.8 Kb)
- Données utilisables comme exemple pour GEPAS - Fichier
au format TXT (729.6 Kb)
- Données utilisables comme exemple pour SAM - Fichier
au format TXT (505.6 Kb)
Travaux dirigés : comparaison de plusieurs expériences
- Document sur le classification des données d'expression à
l'aide de méthodes de regroupement - Document
au format PDF (2 Mb)
- Matrice d'expression utilisée pour le regroupement - Fichier
au format .TXT (4.9 Kb)
Liens et références
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