Plate-forme Transcriptome Service de Genomique Departement de Biologie Ecole Normale Superieure
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/ Accueil / Communications / Formations / 6-10 Février 2006 INSERM

6-10 Février 2006, Les Biopuces

Cours et supports multimédias

Travaux pratiques : protocoles expérimentaux

  • Document détaillant les différents protocoles mis en oeuvre pendant la partie pratique - Document au format PDF (834.7 Kb)

Tous les protocoles expérimentaux décrits et utilisés pendant cette formation sont ceux de la plate-forme transcriptome. Ces protocoles au format HTML et PDF sont disponibles dans la section "protocoles" du site de la plate-forme. Des tutoriaux vidéos sont égalements disponibles.

Travaux dirigés : analyse informatique des images et normalisation des données

Travaux dirigés : recherche de gènes significatifs dans des expériences répétées

  • Document sur le prétraitement des données avant l'utilisation de méthodes de regroupement - Document au format PDF (925.4 Kb)
  • Document détaillant les différentes étapes de la recherche de gènes significatifs - Document au format PDF (941.8 Kb)

  • Données utilisées comme exemple pour SAM - Fichier au format TXT (635.5 Kb)

Travaux dirigés : comparaison de plusieurs expériences

  • Document sur le classification des données d'expression à l'aide de méthodes de regroupement - Document au format PDF (2 Mb)

  • Matrice d'expression utilisée d'après les études de cinétique de la chimère PDR1 - Fichier au format .TXT (619.6 Kb)
  • Matrice après application du centrage et de la réduction par expérience (Excel) - Fichier au format .TXT (475.4 Kb)

Liens et références

Pour aller plus loin :





Dernière mise à jour : 7/9/2011 - 11:04
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