Plate-forme Transcriptome Service de Genomique Departement de Biologie Ecole Normale Superieure
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/ Accueil / Communications / Formations / 9-13 Janvier 2006 ENS Paris

9-13 Janvier 2006, Master (M2) de génetique Paris VII : Travaux Pratiques sur les puces à ADN

Cours et supports multimédias

  • Méthodes bioinformatique d'analyse des puces à ADN, partie 1, analyse d'image et normalisation - Stéphane LE CROM - Présentation au format PDF (18.5 Mb)
  • Méthodes bioinformatique d'analyse des puces à ADN, partie 2, recherche de gènes différentiellement exprimés, comparaison d’expériences, analyse de profils d’expression - Gaëlle LELANDAIS - Présentation au format PDF (663.4 Kb)
  • Support des TDs d'analyse des puces à ADN - Stéphane LE CROM - Présentation au format PDF (3.4 Mb)

Travaux pratiques : protocoles expérimentaux

  • Document détaillant les différents protocoles mis en oeuvre pendant la partie pratique - Document au format PDF (97.4 Kb)

Tous les protocoles expérimentaux décrits et utilisés pendant cette formation sont ceux de la plate-forme transcriptome. Ces protocoles au format HTML et PDF sont disponibles dans la section "protocoles" du site de la plate-forme. Des tutoriaux vidéos sont égalements disponibles.

Travaux dirigés : analyse informatique des images et normalisation des données

  • Document détaillant les différentes étapes effectuées lors de l'analyse de l'image - Document au format PDF (4 Mb)
  • Grille d'analyse indiquant l'identification de chaque spot - Fichier au format .GAL (1.2 Mb)

  • Quelques informations à connaître pour bien exploiter Excel durant cette formation - Document au format PDF (808.9 Kb)

  • Document détaillant les différentes étapes effectuées lors de la normalisation des résultats - Document au format PDF (98.5 Kb)
  • Lien vers le script R qui sera utilisé pendant le TD

Travaux dirigés : recherche de gènes significatifs dans des expériences répétées

Travaux dirigés : comparaison de plusieurs expériences

Liens et références

Pour aller plus loin :





Dernière mise à jour : 7/9/2011 - 11:04
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