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Formations / 8-10 Juin 2005 INSTN
8-10 June 2005, Les Puces à ADN : Pourquoi ? Comment ?
Cours et supports multimédias
- Les techniques de criblage à grande échelle
- Présentation au format
PDF (7.3 Mb)
- Mise en oeuvre pratique des puces à ADN
- Présentation au format
PDF (3.8 Mb)
- Le dessin expérimental
- Présentation au format
PDF (863.3 Kb)
- Méthodes bioinformatique d'analyse des puces à
ADN : analyse de l'image et normalisation - Présentation
au format PDF (16.8 Mb)
- Méthodes bioinformatique d'analyse des puces à
ADN : analyse différentielle et classification - Présentation
au format PDF (22.6 Mb)
Travaux dirigés : analyse informatique des images
et normalisation des données
- Document détaillant les différentes étapes effectuées
lors de l'analyse de l'image - Document
au format PDF (4 Mb)
- Grille d'analyse indiquant l'identification de chaque spot - Fichier
au format .GAL (352.7 Kb)
- Le logiciel GenePix Pro utilisé pour cette formation est décrit
dans la section "outils d'analyse"
du site de la plate-forme
- Quelques informations à connaître pour bien exploiter Excel
durant cette formation - Document
au format PDF (808.9 Kb)
- Document détaillant les différentes étapes effectuées
lors de la normalisation des résultats - Document
au format PDF (98.5 Kb)
- Lien vers le script Goulphar.R
qui sera utilisée pour la normalisation sous R
Travaux dirigés : recherche de gènes significatifs
dans des expériences répétées
- Document sur le prétraitement des données avant l'utilisation
de méthodes de regroupement - Document
au format PDF (925.4 Kb)
- Document détaillant les différentes étapes de la recherche
de gènes significatifs - Document
au format PDF (941.8 Kb)
- Données utilisables comme exemple pour GEPAS - Fichier
au format TXT (729.6 Kb)
- Données utilisables comme exemple pour SAM - Fichier
au format TXT (505.6 Kb)
Travaux dirigés : comparaison de plusieurs expériences
- Document sur le classification des données d'expression à
l'aide de méthodes de regroupement - Document
au format PDF (2 Mb)
- Matrice d'expression utilisée d'après les études de
cinétique de la chimère PDR1 - Fichier
au format .TXT (619.6 Kb)
- Matrice après application du centrage et de la réduction par
expérience (Excel) - Fichier
au format .TXT (475.4 Kb)
Liens et références
Pour aller plus loin :
- À lire : Microarray Bioinformatics de Dov Stekel aux éditions
Cambridge University Press
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